沈陽第六人民醫院是國家級中醫藥防治傳染病重點研究室；中醫肝病科被評為“十一五”“十二五”國家重點專科；傳染科是遼寧省臨床重點專科；中醫傳染病科是遼寧省“十三五”中醫重點專科；肝炎專業、動物源性傳染病專業是沈陽市臨床重點專科, 2017年被市科技局評為沈陽市肝膽疾病臨床醫學研究中心。現為遼寧省免疫學會感染免疫專科分會、遼寧省中西醫結合學會傳染病專業委員會主任委員單位，醫院擁有院士工作站一個，是國家認證藥物臨床試驗基地，全國健康促進與教育優秀實踐基地創建單位。2017年成為沈陽市首批DRGS試點單位。
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